Pharmakotherapie ist vor allem im Bereich der Behandlung von schizophrenen Erkrankungen und schweren depressiven Störungen ein wichtiger Baustein. Häufig kann erst dadurch der Zugang zu weitergehenden psycho- und sozio- therapeutischen Maßnahmen erreicht werden. Ziel ist die Maximierung der Wirkung (Schutz vor erneuter Erkrankung) und Minimierung der Nebenwirkungen. Der Rehabilitand nimmt als gleichberechtigter und informierter Partner am Entscheidungsprozess teil.